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GAGTTAAGTTGCTGCATCATATTCATCTTCTTTCTCGACTATCTCTCTGTGTCCCCTCGT

TT
>PpersV_sc2 [endogenous-virus-name=Prunus persica virus] [strain=sequence cluster 2] [host=Prunus persica cultivar Lovell] [moltype=genomic DNA] [note=incomplete at 3’ end, mutations in ORF1] 7391 bp

TGGTATCAGAGCCGTAAGAGTTACGGTCTTTGTCTAAGTCTGCTACTCATCCCCGCCCAA

GTGGCTGGTTTAAGCTTCTGAGTAGAAGGTCTTCATTTCCTTCCTTTCCTTCCCTTTTAT

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TCCCGAATCAAAAAATATATAAGAAACATTGGTTGCCTTCTAGTTTTAATAGCACAACTC

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AAAAAGCTATGATTGACTTTAAGCTTGAGTCCCTGAGAAAATCCTCTCAGGTAACCCAAC

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TCAGGAGAGATAGGTATCACCAAGCCTACCCTGACAGTGAAAGCCGCCAAAAAATCTTTA

ATGAATGGAAAGATTACATGCGGTCAGCCAAAGTTGAAATCTTTTACCTCGATTTCATTG

AAAGCCACTATATGTCTAATGATGAATTAAAAACTTTAACTAAAGAAAAATGGAAAATGA

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GTTGAAAAACCAATAGTTCAGTTCCAGGATCTTAAATCCAGCCCCACACTTAAGATAAAA

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GATGAAAAATCTGGTCTTAAAACACTAGATTCTTTTCCAAACACAAACTCCTCTGAGTCT

GAGACAACAGAATCTGAAACTAGTAATATTTCAAAAATAGAAAATGCTTTCAAAAATTTA

GAAGTCCAAGTTCAACCCAAAATCAAAAGATTAGATAAACACATAAGCCCCACTAGCTTA

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CTCAGATATTGGTGGGACAAACACCTAACCCCTGAGTCTAAAAATCGAATCACTCATGCT

GTAAAACTCAATGAAGATGGTCTCCCTATATTTGACGAACAAATAGGTCAAGGTATAGAA

GACGGAGTCAACACTTTATTTTACACAATAATTGAGCATTTCATTGGAACCCCTAGTAAT

ACCACTGCTAGGATACATGACCAGCTAAGCAACCTTAGATGTCCCAAGTTGTCTGATTTC

AGATGGTACAAAGATGTCTTCATCTCCAGAGTCATGCTTAGAGATGACAGTAATCAACCA

TTCTGGAAAGAAAAATTTGTTAATGGTCTTCCAAACCTATTTGCCCATAAAATACGCACA

ACCCTGAGTAATGAACAAGGTCATATAGATTGGGATAGTTTGACTTACGGAAACATCATA

AGTACAATCAACCAAGTTGGCATGAAAATGTGTATTGACTTTAAAATTAGTAGACAAATA

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AAAAATTGATAAAAGTTTTGGAGTTGCGAGACTCTGAAACAAGCAATGATGAAACCATAG

TAGCCAGCTCTGAGTCTGATTCTGACCAGTCGACAGAATCACAGTCAAGTTCACCCAATA

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CTAATCCCCAGTCGATTAGTATAAATACTACTTTAGAGAAATTTGCTCAAAAGAAAGAAA

TTACCTTACAAGACCTCCAATTAGAAGTAAAATTGATTAAAAAAGAGATCGTTGAATTAA

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GTAGACTATGATCGTGTCATCTCTACCCATTTAGGCGAAAAGGTCAAATTTGAATTTCTG

TCTAAACCAGAGTTGCATAATTTAAAAACCTTGCAAAAACAGTCAGTGTCCAAATCAATA

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AATGCTGAACTAGAAAGAGGAGTCCCGAGATTAGTTATCAACTACAAGCCACTTAACTCA

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ATGCCATTTGGTCTAAAAAACGCCCCTAGTGAATTCCAAAATATTATGAATGAAATACTC

AATCCCTACAGCCATTTCTCAATTGTCTATACTGATGATGTCCTCATCTTCTCCGAGTCT

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GTTGTTTCCACCAAAAAAATCAAGTTATTCCAAACCAATATCAGATTTCTTGGTTTCAAC

ATATACCAGTCACAAATCTCCCCAATTAATCGAGTCATCCAATTTGCTGACAAATTTCCT

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GACTTTTACCAAAATCTGAGAAAACAATGGTAAGCCCTTATTTGACAGATTATTGCAAAA

CAATCCTCCTCCATGGACAACCACCCATACTGAAGTTGTCAAACAAATCAAAGCCCATGT

CAAGACACTTCCCTGTCTTGGTATTCCCTCAGTCAATTCCTTCAAAATAGTTGAAACCGA

TGCCTCTGACATTGGTTATAGTGGTATCCTCAAACAAAGAATTTGCCCAAAATCTCCAGA

ACAGATTGTTCGTTTTCATTCTGGAACTTGGACCCAGTCGCAAAATAATTATAGTACTAT

TAAAAAAGAAATATTAGCTATTGTACTATGTATTAGTAAATTCCAAGATGACTTGCTCAA

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TCAAAACATTGCATCTAAACAGATTTTTGCACGTTGGCAAAGCATTTTAAGTATATTTGA

TTTTGATATTGAATATTTGAGAGGAAGTGAGAATTCAATTCCTGATTTTCTTACTCGAGA

ATTCTTGCAGGATACACAATGGCACCCAAAAAAGACAAGCAAAAAGAATCAGCCAATCAA

CCTAAGCCACCCCAGTCGCTCCGAACCCTTCCTCCATCCATGAGTCAAAATAAGCCAGAA

ATGCCAGAAATGCCCAAACAGTTGATTCCTTTTCCTGGTTGCACTCCCATTTCAGTTGCC

ACGCCAATATCAGTTGCTAATAGGTTTTCTACCCTAGGATCCACAGTTGGCCAAATCCGC

CCCAGTTATCAGTCAACCCTAGTCTCTAGTTATGATCCTTTTTCAGTAGATACCCCAGCT

GGCCCCTCAGTTGCCTTCAAAAAATCATCCCCTTATTTGCCCAAAAGCAATTCTCACTTG

TTTGTTATTGAGCCTGTTTATGATATTCATACTGATCCCATTGAAATAGCCAAACACTAT

TTCCCCCCAGGATTTCATTATATGCCACCCAGTCCATACAAGTCTCTCAAGTATTATAGG

GATATACTACTTGAAACCCAGTCAGTTGAAATCAAACCAATAAAGGATCGAGATCACCCT

GAGATCATCCTTTATCATTCCCTTTATATTCACAAAATCCTGAGCCAAGAATCTTTTAGT

AGCCGCCCTTATGAATTAAAGCTCCTTAAGTCAAAATTACAATATAATTATTCTGATTAT

ATTGAAGCCTGGTACTCTATTTTCCTCCACCAATCTGAGGATTTTAGCCATTCCTGGTTT

ATCAATTTCGACAATAAGTTCAAATGCTCTTTTCCCTATTGGTTCCTCCATTGGTGGGAA

AAACATGGTCCAGTTGATGAAATTTTGCCTGTCTCAGTTCATGAGTTAATTCGCCATTAT

ACCAAAAAAGCCAAATTCTCCAAAGTTGATTTATTCTTCCCAAAACAGTTGCTCTTTATT

GCCAGATATAAAGTCCCTTGGATCCTCAAATGGTCCTACAGAATAACCAAAGATGCCAGA

ATATTTGCCCGTCAATTCTCTGTTAAATGGTGGGACAAATTTGAAGTTGAAAGAATTGCC

AAGTATGTCTACAATGATCTTCCCCATGAGCCTATTCCGCACCCAGTTTCTCCTACTGGT

TCAGTTCGATCTTCTCTCTCAGTCGAAGGGAAATCAAAGTCTGAACTCCAAGAAATTGCT

CGCCAGTTGATCATTCAAGCCTCTCAAATGGATGATGATGAAGACAATGATTCTCCTTCG

TCATCTAGTTGCCAGCCAATGCAGAGCCCTGCCAAGCCTAAGTCCTGGTATGAAGATAGT

CAAGACCCCTATGATGCCTATGACCTGCACTCTGATTAGGCTCCTAGTTGCAGACACAAT

AATTGCCCCAAGTTGCAGACAAAATAATTGCCTCGGTTTGAAGCATCCATCCGCTTTCTC

ATCACTTTACCAAAAGTGGCATGAGCAAAAGAATAGTAAAAGTTATTCCTTCATAAAAAG

ACAAGAGTGAAAGTTGAATCAGTTCCTTCCCGTGCCTCTACAGTAGCATTAACCGTAGTT

GCTTTTTACTA


>PperV_sc3 [endogenous-virus-name=Prunus persica virus] [strain=sequence cluster 3] [host=Prunus persica cultivar Lovell] [moltype=genomic DNA] [note=incomplete at 3’ end, mutations in ORF1] 6866 bp

TGGTATCAGAGCCGTAAGTGTTGAAGAGTCGGTCTAAGTTTGCAATTCATCCGCCCAAGT

GGCTGGTTTAAGATTTCTAAGTCGAAGTCTTCAGTTCCTTCTTCTACTCCTTCTTGTCTT

TCAGTTTACCTGTCTTTTTCTCTCTGGTCCAAACAGTAAGTCCTAGAGTCCAAACAGTAA

GTCCCATGTAGAGGCATGAGCGGTTGCGGCCTGAGCGGAGAGAGAAAGAATCACTAGGTG

TCCTATAAAGCCATAAATGAGGAGTTTCTATTTATCTTCTCCTTTAGAAGTCTAGTCCAG

AACCTTGAGTAATGAGTCGCTTATTTAGAACCAACTCTTGTAACTCTAGCAGTTCTAGAG

CCAGTATAGTAAACTTCCAGAGATAGTTAATGAAGAACAAGTTGAATTTGAGTCTAGTAA

TGAATTAGATTACAAAGATTGGAATATACCGAAAATCTCTAGTCAAGATATTTATAAGAA

AAAATGGTCGCTTTCCAGTTTCAAGTCAACCACCCATGTAAAAACAGTCGAACAAGTTTA

TGCTTTAAGTAAAGAACATGAAACATGCCAGTTGCTTAATCTTGAGTCAATTAAGAAACA

TAAAAATGATGGAAATAATTTCTTTCACATTGGTCTAGTTCAAGTTGTAGTTAAACCTCT

AACCAGATTAAGATTAAAAGCTTCTATCCTTCTCTGTCTTAGAGATGCTAGATTCACCAG

TTTTAGTGACAGTATCCTAGGAATAATTTAATCAAGTCTGTTTAATGGTCCAATTCATTT

TGATTGTTATCCAGATTTACAGTCAGTCTCAATGATACTCACATAAAAACCTTAACTTTA

AATATCAAAACTTCTGGGTATGAAGTCTTACCAGGTACCCAGCCATTAGCCCCAGTCTAC

CGAATTTACTACAAAGTCACAGGTACTAATATGAATTTCCAAGCTTTAAATAAAAGTCCA

AAATATCAAACCTTGTTAATTCAAAGTAACAAAGCCGATGCCAACATTAGAGTTCCCCAT

ACAATTAAATGGTCAGAACTTACCCTTCCATTAGATTGGACGTTAACCACAGAGAATCAA

CCAGTCCCCATTCAACACAGTTTAAACAATTTAGATTACATTCAACAATATTTAGATGGC

ACAGCCAAAATTAATTTTGGAAGTCAACCTCCACAAAAGTCCTCAGTTCAGTTACACCAG

TTGCCTACACCTAGTCAATCCCAGAGACATGCCCCTGCAAGACATTCTTACACAGTTTCT

TCCTCTACTCTAGAGCGAGATCTAGAATTAGAAAAAACCTTAATTGATTTAAAATTAGAA

TCCTTAAGAAAAACTTCCCAAGTTAACCAGCCCTGTTATGGTAAAAAACCAACAAAAGAA

GATACTAAGTCAGAATCTTCAGAGTCACCCACACAAACCGATTTCGAAGCCGGTTTTCAA

GTTGATAACCAATTAAGAATCCTCAATAAAAAATTTAAGATTAATTGAAAAAGTCTAGAT

AATCATTTACATGCCCCAGAGAATCAAAAAAGAAGAGACAATTATCACAAAGCCTACCCT

AGTCGAGAAAAACGACAACAGATCTTTAATGAGTGGAAAGATTATATGCGTACAGCTAAG

TTAGAAATTTTCTACCTTGATTTTATTGAAAGTCATTATTTATCTAATGAGTTAAAAACT

TTAACCCAAGAAAAATGGGAAAAAGAAGATAACACCTAAGTCATAGCCACTCATCCTCCA

GTAGAAACAATAGTCATTACCCATAAAAAGTCAAAAATAGTTGCCAGTCCCTTCAAAGCC

CCTGTCCAAAATGATAGAAAATTAGTTGAACATAATAATTACACCAACCAAAGTCTAATA

GTAATAAGGAATCAATTAGATAAAATAGAAACTAAAATTGACAAAATACCCCTTCAGAAA

CAACCTCTAAGTCACAATAAGAAAAACCTTTAGTCAAATTCCAAAATAAAAGAGTCAATC

CCAACTTTTAAGACAAAACCAACAATGAAAAAAATAGAAGAAATGCTAGAACAGTTAACC

CCAAAGAACGAAAAAGAGAAAATTGAAAAATCTGGTCTTAAGGTCTTAGGATCCTCTGCT

TTAGTCAATACCTCTGATTCCGAGTCAGTAACCAGTATGGAAACAGAAACCAGTAATATC

TCTAAAATTGAAAATGCATTCAAAAATTTAGAATTAGAAAATGATCTAAAAATTAAAAGA

TTAACAAACAGAGTCAGCCCCACGAGTCTAACCAAAAATTGGTACCCTAAGTCAACTCCT

CCAGACATCCAATTTGAAGAGAGAAATTCCCAAAGTCAATTCTCAGTCTCCTCCGATAAG

TTATATGAATGGAATATTGATGGTCTTTCTGAACAAGAAATTCTTAATAAACTCCAACAC

ATGTCAATGGTAGCCAATAGCTATGTAACCAATCACAGTTTTAGGCAGTCAGAAATCGTT

CCTTTGTTAGAAACATGTTTCATCGGAACCTTACGTTCTTGGTGGGATAAGCACTTAATA

GAAGAGTCAAAAAGACAAATAATTCATGCAGTCAAACTTAATGAAGAAGGTCTTCCTATC

TTTGACGAAAAATTAGGTCAAGGTATAGAAGATGGAGTCAATACTTTGTTGTATACAATA

ATTGAACATTTCATTGGAACACCCAGCAATACCACTGCTAGAATTCATGATCAGCTTAGT

AACCTTAGATGCACAGTCCTTAGTAATGATCAAGGTCATATAGATTGAGATAATTTAACC

TATGGTAATATCATTAGTACAATTAATCAAGTCGGAATGAAAATGTGTGTCGACATGAAA

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