Additional file 11: primers for rt-pcr

tarix	25.06.2016
ölçüsü	71 Kb.

Additional file 11

Additional file 11: primers for RT-PCR

	Forward primer	Reverse Primer	Pro	Tem
HOXA1	GAGCACCCTATCCTCAACG	GCTGGAGTGGGAATAAGACAT	249	57
HOXA2	CTTTATCAATAGTCAGCCGTCG	GGAGGAGGAATCAGTGTCG	123	51
HOXA3	CTACTACGACAGTTCGGCAATC	TGGTGAGACAGAGGGAGGG	394	57
HOXA4	GGAGCTGGAGAAGGAGTT	CTTGGTGTTGGGCAGTTT	157	53
HOXA5	AGCCATACAGGGATTCAGC	CGATGTGCTCGTGGAGTTAG	293	56
HOXA6	TCCATTTTAACCGATACTT	TTTTCCTCTGTTTCTTCG	169	49
HOXA7	TCGCCAGACCTATACCCG	CAGCAGATCCCTCGTCCTT	188	55
HOXA9	GTCGGTCTTCGGCACTTC	CTTCGCTGGGCTGCTTAT	317	57
HOXA10	GGTCCTGAGCAAACGCAATG	GCCGAGACTGAAGCGAGCA	642	61
HOXA11	ATATTAACAAGGAGAAGCG	TTAGAGTAGCGGGTTTGC	149	48
HOXA13	AACGAGTGCCTTACACCA	TTGTCGCTCGGATAGATT	123	48
HOXB1	CCTCGTTATGGAAGTGGTC	TCAAAGGTTTGGGTGGTG	404	51
HOXB2	ACTTCAGGACGGAGGTGG	ATGCTGGTTCTGTCGTTTGT	211	55
HOXB3	CAGCACCAGTAGCAACAG	GGCACAGATAGCGATTGAA	350	56
HOXB4	TACCCAGCAACCACTCGC	TCCGCATCCAGGGATAGAC	324	60
HOXB5	CCGAAGAAGCAAGTCAGT	CTGGTAGCGAGTGTAAGC	188	53
HOXB6	GCCTCTTCTTCCTACTACCCA	GAACACTTCTGCTCCTCACTCT	209	57
HOXB7	CGTAAACGAGGCCGACAG	GGCAGGTGGTCTTGTTCT	193	53
HOXB8	TTAATCCCTATCTGACTCGC	TCTGCCTTCTGTCCTTCC	223	53
HOXB9	GGACGCTTAGCAGTTATTATG	ACGCTCTGGTGTTGGATA	247	55
HOXB13	ACCCGATGGCTGTTCCTA	GGTGGCGTTGGTCTTGAT	229	56
HOXC4	GTTTCATTACAACCGCTACCT	GTGGTCCTTCTTCCATTTCA	124	52
HOXC5	CACCGCCTGCTCCTTCTA	AGCCGCCTTCTGATTGTA	164	55
HOXC6	AATTTCACTTCAACCGTTACCT	TTCCCGCTTCTCCTCCTT	203	56
HOXC8	CCAAATACAAAGGCGGTGAG	GTGCGAGGCGTGCTGAAA	131	56
HOXC9	CGCCACTACGCCCTCAAA	TCGGGTCCAGTTCTGTCTTCT	199	60
HOXC10	CCTACCCGTCTTACCTTTCG	GGGCTGTCTCAGGACCACT	180	55
HOXC11	TGACAGACCGACAAGTGA	CAGTAGAGGGTTCCCAGAG	101	48
HOXC12	GCAAACCCTACTCAAAGC	CCTGCTGGTCACTAAGATTC	120	52
HOXC13	GGACAGTCAGGTGTATTGC	GTTCTGAGAGGTTGGTAGTG	236	53
HOXD1	ACAGGGCTCCGCATACGAC	TTGGCCGCTGAGAATGAAAG	127	58
HOXD3	TTTCAACCGCTACTTGTGCC	GGTGGTCGTACTCCTGTCCTG	365	58
HOXD4	CGTCGTCGGATCGAAATA	GTGTTGGGCAGTTTGTGG	110	51
HOXD8	ACGCTCTAGGACTCACC	CTGGCCCTCAGCTCTATC	171	50
HOXD9	ATCCACGCACGTTCCACC	TTTGACCTGCCTTTCTGT	153	50
HOXD10	CAAACACTGGAATTAGAAA	GAGAAGGTCAGATTAGCG	191	49
HOXD11	GCAAGCCCTCGTTCCTGTC	GTCCCTGTGCATCACCTCCT	185	57
HOXD12	CAGATCCGGGTATGTGGG	GCTAGGCTCGTTGGTGAAA	346	57
HOXD13	GTTCATCCTCTTCCTCCTC	CTTGAGTGCGTTCTGTTG	221	56
HOTAIR	AGGCCAGTGTTTACAAGATC	AGGCGTTAGTCCTCCATT	81	50
HOTAIRM1	TAAATCCCGGACGCTCCT	CAAACCCAGCCAAAGGAG	308	59
HOXA11AS	ATCGGCACTTGGTATTCTC	TAGCCCTGAAATAGATAGACG	449	56