Zakład Genomiki Zespół Genomiki Strukturalnej i Funkcjonalnej Roślin Strączkowych Specjalizacja

tarix	25.06.2016
ölçüsü	46.5 Kb.

CV
Dr hab. BARBARA NAGANOWSKA, prof. nadzw.
E-mail: bnag@igr.poznan.pl

Telefon: (+48 61) 65 50 231

Zakład Genomiki
Zespół Genomiki Strukturalnej i Funkcjonalnej Roślin Strączkowych
Specjalizacja: genetyka, cytogenetyka molekularna roślin, genomika roślin strączkowych
Profil badawczy

Cytogenetyczna analiza genomu Lupinus angustifolius metodą FISH z użyciem klonów biblioteki BAC genomu jądrowego jako sond molekularnych (BAC-FISH).

Integracja mapy genetycznej i fizycznej genomu L. angustifolius poprzez identyfikację markerów cytogenetycznych i przyporządkowanie grup sprzężeń do chromosomów.

Analiza struktury i organizacji regionów genomu łubinu wąskolistnego zawierających geny związane z ważnymi cechami użytkowymi (odporność na grzyby patogeniczne, indukcja procesu kwitnienia, symbiotyczne wiązanie azotu atmosferycznego, synteza fenylopropanoidów, synteza kwasów tłuszczowych).

Porównawcza analiza cytogenetyczna genomu łubinu wąskolistnego, żółtego i białego.

Filogenetyka molekularna wybranych gatunków z rodzaju Lupinus, ocena syntenii w obrębie rodzaju oraz pomiędzy łubinami a innymi gatunkami roślin strączkowych.

Projekty badawcze krajowe i międzynarodowe

MNiSW

Projekt nr N N301 391939

Tytuł projektu: „Genom jądrowy Lupinus angustifolius L.: struktura wybranych genów, ich lokalizacja genetyczna i fizyczna oraz analiza porównawcza wybranych regionów genomu z innymi gatunkami roślin strączkowych”.

Kierownik: B. Naganowska

Okres realizacji: 15.09.2010–14.09.2013
Projekt badawczy zamawiany. Zadanie nr PBZ-MNiSW-2/3/2006/3

Tytuł zadania: „Identyfikacja markerów molekularnych sprzężonych z genem odporności na grzyb patogeniczny Diaporthe toxica wywołujący brunatną plamistość łodyg u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius L.)”.

Wykonawca: B. Naganowska

Okres realizacji: 21.08.2007–20.02.2011

Projekt nr N301 084 32/3234

Tytuł projektu: „Analiza struktury regionu genomu Lupinus angustifolius zawierającego gen odporności na antraknozę”.

Wykonawca: B. Naganowska

Okres realizacji: 9.05.2007–8.08.2010

Projekt nr 3 P06A 009 24

Tytuł projektu: „Struktura genomu jądrowego i filogeneza rodzaju Lupinus w świetle badań molekularnych i cytogenetycznych”.

Kierownik: B. Naganowska

Okres realizacji: 31.03.2003-30.03.2006

MRiRW

Projekt nr: HOR-hn-801-11/12/13

Tytuł zadania: „Cecha wczesności kwitnienia u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius) – podstawy genetyczne i molekularne".

Wykonawca: B. Naganowska

Okres realizacji: 1.1.2011-31.12.2013

NCN

Projekt nr 2011/03/NZ2/01420

Tytuł projektu: „Cytomolekularny wgląd w genomy Lupinus”.

Wykonawca: B. Naganowska

Okres realizacji: 14.08.2012-13.08.2015

Międzynarodowe

Nr projektu: FP5 QLK5-CT-2002-30379

Tytuł projektu: “Centre of Excellence in Plant Agrobiology and Molecular Genetics [PAGEN]”. Kierownik pakietu WP9.

Okres realizacji: 2003-2006

Współpraca krajowa
Uniwersytet Śląski w Katowicach, Katedra Anatomii i Cytologii Roślin. Cytomolekularna analiza genomu rodzaju Lupinus.
Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu, Katedra Biochemii i Biotechnologii. Poznanie sekwencji i organizacji wybranych genów kodujących enzymy szlaku fenylopropanoidów u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius L.).
Instytutu Chemii Bioorganicznej PAN w Poznaniu, Pracownia Biologii Molekularnej Roślin. Poznanie sekwencji i organizacji genów kodujących enzymy związane z procesem symbiotycznego wiązania azotu i rozwojem brodawki korzeniowej oraz kodujących podjednostki karboksylazy acetylo–koenzymu A u łubinu wąskolistnego.
Uniwersytet im. A. Mickiewicza w Poznaniu, Instytut Biologii Molekularnej, Laboratorium Genomiki Obliczeniowej. Funkcjonalna adnotacja sekwencji końców klonów BAC z biblioteki genomu jądrowego L. angustifolius w celu identyfikacji genów kandydujących dla ważnych cech użytkowych.
Współpraca zagraniczna
- prowadzona w ramach umów

Department of Agriculture and Food Western Australia, Perth, State of Western Australia. International Genetic Material Transfer Agreement. Wymiana materiałów roślinnych (populacje mapujące) oraz mapowanie genomu łubinu wąskolistnego i białego.
- prowadzona bez umów

University of Western Australia, Perth, Australia. Genetyczne i cytogenetyczne mapowanie genomu oraz badania struktury genu FT, odpowiedzialnego za wczesność kwitnienia u L. angustifolius.
UMR CNRS Ecobio, Université de Rennes, Francja. Poznanie genów związanych z procesem nodulacji i symbiozy u łubinów.
Faculdade de Agronomia Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Departamento de Plantas Forrageiras e Agrometeorologia, Brazylia. Analiza wielkości genomów łubinów Nowego Świata.
Institute of Experimental Botany, Olomouc, Laboratory of Molecular Cytogenetics and Cytometry, Republika Czeska. Mapowanie cytogenetyczne rDNA w rodzaju Lupinus. Konstrukcja biblioteki BAC genomu jądrowego L. angustifolius.

Publikacje
Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Majcherkiewicz K., Przysiecka Ł., Karlowski W., Wolko B., Naganowska B. (2013). Comparative genomics of Lupinus angustifolius gene-rich regions: BAC library exploration, genetic mapping and cytogenetics. BMC Genomics 14: 79.
Lesniewska K., Książkiewicz M., Nelson M.N., Mahé F., Aïnouche A., Wolko B., Naganowska B. (2011). Assignment of 3 Genetic Linkage Groups to 3 Chromosomes of Narrow-Leafed Lupin. J. Hered. 102 (2): 228-236.
Wolko B., Clements J.C., Naganowska B., Nelson M.N., Yang H. Lupinus. In: Wild Crop Relatives: Genomic and Breeding Resources. Legume Crops and Forages. Chittaranjan Kole (ed.). Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2011, pp. 153-206. DOI 10.1007/978-3-642-14387-8_9.
Strzalka W., Kaczmarek A., Naganowska B., Ziemienowicz A. (2010). Identification and functional analysis of PCNA1 and PCNA-like1 genes of Phaseolus coccineus. J. Exp. Bot. 61 (3): 873–888.
Kaczmarek A., Naganowska B., Wolko B. (2009). Karyotyping of the narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.) by using FISH, PRINS and computer measurements of chromosomes. J. Appl. Genet. 50: 77-82.
Kaczmarek A., Naganowska B., Wolko B. (2007). PRINS and C-PRINS: promising tools for the physical mapping of the lupin genome. Cell. Mol. Biol. Lett. 12 (1): 16-24.
Kasprzak A., Šafář J., Janda J., Doležel J., Wolko B., Naganowska B. (2006). The bacterial artificial chromosome (BAC) library of the narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.). Cell. Mol. Biol. Lett. 11: 396–407.
Naganowska B., Wolko B., Śliwińska E., Kaczmarek Z, Schifino-Wittmann M. T. (2006). 2C DNA variation and relationships among New World species of the genus Lupinus (Fabaceae). Plant Syst. Evol. 256: 147-157.
Naganowska B., Zielińska A. (2004). Localisation of rDNA in the Lupinus genome during the cell cycle. J. Appl. Genet. 45 (2): 189-193.
Naganowska B., Wolko B., Śliwińska E., Kaczmarek Z. (2003). Nuclear DNA content variation and species relationships in the genus Lupinus (Fabaceae). Annals of Botany 92: 349-355.
Naganowska B., Doležel J., Święcicki W.K. (2003). Development of molecular cytogenetics and physical mapping of ribosomal RNA genes in Lupinus. Biologia Plantarum 46 (2): 211-215.
Naganowska B., Zielińska A. (2002). Physical mapping of 18S-25S rDNA and 5S rDNA in Lupinus by fluorescent in situ hybridization. Cellular & Molecular Biology Letters 7 (2B): 665-670.