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AAAATCCTCTCCAAAACATTCAAACGAATTTTTAAGTTTTAATATTTTCTCTTCGATCAA

ATCTTGTAATCAAATCTGTAAGTT
>BrapV [endogenous-virus-name=Brassica rapa virus] [host=Brassica rapa cv. Chiifu-401-42] [moltype=genomic DNA] [note=incomplete at 3’ end, mutations in ORF 1] 7881 bp

TGGTATCAGAGCCATGGTTGGGTAGGCGTCTAAAGTTTTGGGTGTTGGTGATCTATTAAT

TTTTCCTCCCTTTGGTTCTTATAGGTTAAAATCTTAGTCCTCCTGAGTGTTTTTGCCGGT

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TTCAACCTCGGATATTCCAAATTCTGTTTTAAGAAATGTTAATTTTCAGTCACAGATTCC

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TAGGCAAAACCATAAAGATCGTCAATTAATCTCAGCCCCTGATCTAGGACAAATCCAACC

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AATTAGAGATTCCATGGGAACCCAAATAATAGATTATGATGATTTCACTTATGGAGAGTT

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TCTTAAATGGGAACTCAAAAGAACGAAAGTAGAATTAGGATCATTCTGTAAACAATTTGA

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TCGTCCAATTCAAATGAACTCAGAATTAGAAAAACATTGTAGAAAAAAAATTTCGGATCT

TCTAGAAAAATGATTAATTTCAAAATCAAGATCCCCTAGGTCTCGTGCTGATTTTTATAT

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AAACACTGCTTTAAAATGGATTGGATATCCAATACCAAATAAAAATATTTACTACAAAGA

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GTTTTAGATTTCTGTCCTAATATAAATAGAATAGCTAAACCGTTGCACAATCGTCTAAAG

AAAAATCCAGTTCCTTGGACAAAAGAACATACTGAAATAGTTCAAAGGATTAAAAAACAG

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GATGCTTCTGATATAGGATATGGGGGTATTCTTAAACAAAAGAAGTTAGATGGTCACGAA

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AAAAAAGAAATCTTGAGTATAGTTTTGTGTATTCAAAAATTTCAAAGCGATCTTTTAAAT

AAAAAATTTCTTTTAAGAATTGATTGCAAAAGTGCTAAAGATGTTTTACAAAAGGATGTG

AAAAACCTTGCATCAAAACAAATTTTTGCGCGATGGCAAGCGATTTTGAGTATTTTTTAT

TTTGAAATTGAATTTATAAAAGGAGATTCAAACTTTGTCCCAGATTTCTTGACAAGAGAA

TTTCTCCAAAACAGGTACAATGCCTCCGAAGAAGATGATTGACAAAGGCAAGGGAATTTC

CCTGGAACCAATCTCAGAAAAACCCGAACCTACAAACACTAACCCAAAAACAGAACCCTG

GATCTCAGTAACAAAAAAGAGTGCTAAAAAGGAAGAAATACCAACCACCCCAAAATCTCT

CCAATCTCCAGAAGCTATCATGAATCAAATGTTACAATTGCAAAAAGCTTTCGAACTTAG

TTTTTCAAAGCAAGAGTCGGGAGAATCTTCCAAAAACCTTCCTTCTCAAGCTATTTCAAA

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AAAACCTTCAAATAATTCACAAATTATTTTGAAGGAGATTTCCCAAACCACTCCATCGGA

GTATTTTGAAAAACACACATACCAAAATATTATAAATATCGAAAAGGGATTTTTTGTGAA

CAATGATCCGTTTTTAACAATCGAAAAATATTTTGGCAAAAACAATTTCTTTAAACCACA

TAATACAGATAAAACTGTGTTATTCTTTCAAACCATTTTGGAAATTACAGATTCAGTGTC

CTTCAAACATTTTTATCTAAACGAAAACCACACTGATGCTGCTTATTCCACATTCAAAAT

CCATAAAATCATTGCGCCATGTGATTGGGAATATGATCTTAACGACAATCTAAATTTTCC

AGAAGATCTTAAAAATCTCCCTTGTTACAATGTCCCCTTTAACTATTGGGATTATTGCCA

AGCATGGTACAATTCTTTTTTGATCCAATCTCCTAAACACAAACACACGTGGTTGATCTT

CTTTGACACCACCTGTAACTTATCCAAATCTCCCTATTGGTTCATACCATGGTGGAACTA

CTTTGGTTCTGTCACAGAAATATTTAAACCCAATATCCAAAAATCATTCCAAATCTTCAA

GACAAATTTCATTCCGTCTGAAGAAGAAAAGAAATTTCCCCCACTAGCCCTCTTCCACTC

AAAATTTCATTTTCCTTGGGTTTTTTCATGGACCCTAGAATTTACTTCTGATCCAATTCC

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TTACCCGTCAAATATTCTTACCTGGATAAAAGAACAAAACTCAAAAATCCAAACACTTAA

CCAAACACAGAACCAAACACCAGAGACAACCTTTTTCTTGGCTCAAAAATCCAAAATGTT

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GTTACGAATATTTTCCACGATCTCTTGTCGCAATACCCGATAAAAATCCAAAACATCAAA

TAAGTGCTATCTCCTGTAGCCATGAAGACCAAGGTCCACTTCCAGCAGACAGCAAACAAT

TATGGAGCTTAATGGAGCAAGCTTTTGCTAGTGGAGTTATCCATATATGCCACTTTTATT

TTTATTTTTATTTTTATTTTCATAATTTCACCCTTGTAAACTCCTATATAAAGGAGTCTT

TGCTTCAGTTGTAAACCAAGTTCTCATTCTCTCATTCTCCTACTCTTTCATTCATATCCT

CTCTTACATTCTCTCCAGTCCTTGTAATCGAGAACATTGCTACAATCTCTTTTTAAGTAA

GTTTTTAATAAATAAAGTTTCAATTATATTTTTCTTGTTTCATTTTCTCGTTTTAGTATT

ATGCTTTATGTTTAAGTGGCTGGTCTAACCGCCCATATTTCTGTTTTATTTTTAAGTTAT

ATTTCAATCTGTTTCATATATGTCTTAATTTACTTTTTATTATAAATGTTTAATTATGCT

TTCTCCAAGACCGTTGTCTGA
>CrubV [endogenous-virus-name=Capsella rubella virus] [strain=sequence cluster 1] [host= Capsella bursa-pastoris] [moltype=genomic DNA] [note=incomplete at 5’ and 3’ ends, mutations in ORFs 1 and 2] 6232 bp

CATAGGTGTTCCACGCTGTAAGTCCCGAAGGCAGTGAGTCCGTTGGTAAGCCCGTGCATC

ACCCGTCGTCGATAAGATCGGTTAGTTTGCATTTTAGCATGAGTTTAAGAATATTTTAAA

CATGGCATCTACGGTTAGAAAGTTGTTTAAGTCTAAACATGCATCATCCTCTACATCTCA

AAAAACAATTAATTCAAGAGAAATCATGTCAAAAATTACAACTTTTAATCAAGAAATATC

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TAAAACAGCGTATTCAATAAAAGAACATGAACAAACTTTATCTTTACAAAATGAATTTGA

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TATTCATTTCGGTCTAATACAAATAGCAATAAAACCTTTACCCAGAACAGGGATAGATTC

TCCAATACTTATGTTATTAAGAGATAAAACTCTTTTAAAGTTTAAGGACTCCTTGTTAGG

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ATCTACATCTGAGTTTAATCCTCGATGTTTGTTGCAAGATGATAAAGGCGAAACAACAAT

ATTAGCTGTACATAGTAAAGATACTCCAACCTCTACATATACACCCAAACAATTAAAATG

GACAGAAATAACAATCCCTGATCAATGGAAAATTAATATTACTCAACCACCACGAAACTT

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TGGTTCTTTCAGAGATTCACCATCATTAAAAATAAGCTCTTTTTACCCACGTTCATCTTT

CTCTGACTATAGAACTCGCCAAGATAGTACTGAATCCGAAGAAAGTATAGAACAAATTTT

AACAAAAAACCAAGAGAAAAAACCTATTAACTTTCAAGCACCAATAGCTGAACCAATTCA

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AATAAATGTTATTTCGAAAGTATTTACGATAGATAAGCACTATCTTAAAGAAGAATTTTT

ATCACATCAAAATAGAGATAAAAGAAAATGGTACTTTGAAACTTTTACTAAAGAAAAACT

TACAAGTTTTAGAGAAATATGGTATAGTTACATGGAAATTATAGAAATAAATATTCCATT

TTTTACATGGTTTGAAACCTACGCTTTAGAAAACAAAATAGACTACCCATATAAAGATAA

ATCAATAAACACTAGTTCAACCTTATCTCATACGTGGTAAATGACTAATGGGGAAACACA

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TCAACCATTGTTACCACCTTTTAACACAATATCACCACCCCTCTTTAAACCATTAACTAA

ACCCATCAAATTCCCAGAAAATGAAATTTTAAAATCAATTTCAAGTAGACTAGATAGACT

AGACAAAGGTAAGGGTATAAACAATATTGATGAAAACATTCAGTCTGAAACAGATATAGA

AATAAATCGAATAAAAAGAAACTTCCAGCAATCCAAAAAACCATATTATCCAAGACACTC

TCCACCCGACCTATTATTTGAAGAGCATAATAAATTTCCCTCCACAAACTTTTATAACGG

GGAAGGGATATATGAATGGAACATAGATGGAAGGTCCGAATATGAAATGATGAACTTATT

TCAAGAAATGGGAATGGCTACGTTAGCTTATAAATCTAAAGGAATGTCAGATAAACAAGC

ATGTCTACTCTTAATCTCAGGGTTTAATGGTGCCTTAAAATTTTGGTGGGATAATGCCTT

AGATATAACATCACAAGATTCTATTATAAACCACACTGAAACTAAAAGAGTAGAAGGGGA

TGATGGTTTTTATGAAGAAGAACAAGTTCAAAACGCTGTAGAAGTATTACTTCATACCAT

CACCATGCATTTCGTAGGAAATCCTTCTGAAGAACTTACAAGTAAAAAACTTATTTTAAC

AAACCTTCGATGTCCAACACTAGGAGACTTTAAATGGTATAAAGACATATTTATAACAAA

CATATTTCAAAGAAACGACTGCAACCAACCCTTCTGGAAAGAAAGGTTCATTGCAGGATT

ACCTTCGTTCTTCGCAGAACGATTAATTAGTAAACTAAAAGATTTTTCTGGCGGACAACC

GGTACCTTGGGATACGATAACCTATGGTCAGTTGTTTGCTTTTGTTAAAAAAGAAGGATT

ACAAATATGTCAAGAACATAAAGATAAACAAAAAACTAATAAATTTAAATTCGGTGAAAC

TATGGGCTCATTTTGCGAGCAATATGGTTATCATCGTCTCACTCCACCATCTAGAGAAAG

ACAAAAAACACGTAAACAAAATAAATCATTTTACCCACAACCTTACAATAAAAGGAAAAG

ATTTTCAAAAAGATTTTCTAACTCGTACTATACAAAAAATAAAAATCCAAAACAACCAAA

TAAAAAAGAAAAAATTATATGTTGGAACTGTAAACGACCAGGACATAAATCTACTGATTG

CAAAATGAAAAGAAAAATTACTGAAATATTCCACGATCAACAAGACATTAAAGAAAAATT

AGAAAAGTTACTTCTTTCGGAAACAGAAAATTCAGAAGAACTTAGTAGCGATCCTTCTCT

AGACATAATAGAAAGTGAAAGCGATACATCAACTTAAAACTCTGGGAATTACTCAGATGA

TATATGCAACTGTAAAACAATAAATGTAATAACTAAAGACATCGATAAACAATTTTTAAT

AGATATTATAGACAAAATAGATGATCAAGAGACTAAAAAGGAGTATTTATTAAAATTAAA

AGATTTAGTGCAAAGGGAAAATCAGTTGCTAACCCCACAACCATTTAGTCTTAATAGAAT

AATAGAAAAGTATCCTTCCCCAACACTATTTAAACAAGTAACTACCGGTGAATTACAAGG

AGAAGTAAAAAATTTAAAAGCACAAATAAAAGAATTATAACAAATAGTTCACCAACATCA

ACTTCACCAACTACAAGTAGACGCTAGACTAGCTCTTATAGAACCCAAAATCCGCCAACC

TCAACCCATAACAACGGATGAACCCTCCACAAGCAACCCTGATAAACATGAGAAAACAGA

AGAAGAAGAATATATCCAAATAATAAATAAAATAAACTATCAAAAATGGTATACGAAAAT

AACATTACATTGGGTATGATTTTAAACTAGAAACCATAGCACTTTTAGATACAGGAGCTG

ATTATAACTGTATTAGAGAAGGAATAATTCCTACAAAATTCTACAAGAAAACATACGAAA

AACTTAGTGGTGCAAACGGAAGCAGTTTAAAGGTCAATTATAAATTACCTAAAGCAAAAA

TTTGTAATAAAAACTATTGCTTTAAAACACAATTTATCCTTGTAAAAAATTTAAGTCAAG

AAGTTATACTAGGAACTCCATTTTTTACACAAATTTATCCATTTAAAGTTACAGAGCGAG

GAATTACTACAAAAATTGTAGGAGAAAAGATAATATTTGAATTTCTATCACCTATGAAAA

CAAAAGAAATTTTAGCTTTACAGAATTCCACAATAGAAAAATCTATAAACTTAATAGATA

GAAAACAGAAACATATTCTATACTTACAACAAGAAATAAAATACCAACAAATAGAACAAC

AATTACATGATCCACAAATAATAAATAAAATAAAAAAATTAGAAACTGAACTTTTAGCCC

AAGTATGCTCTGAACTTCCAAATGCATTCTGGGAAAGGAAAAAACATATTGTTGAAATAC

CCTACGAAAAAGACTTCAACGAAAAGCATATTCCAACCAAAGCTAGGCCCATTCAAATGA

ACCAAGAACTATTAGAACATTGCAAAAAAGAAATACAAGAATTGCTTGATAAAAATTTAA

TAAGAAAATCTAAATCTCCTTGGAGTTGTTCAGCATTCTATGTGAACAACCAAGCTGAAA

AAGAAAGAGGAGTACCTCGCTTAGTAATCAATTATAAACCCTTAAACAATGTAATACAAT

GGATAAGATACCCAATACCCAATAAAAGAGATCTACTAAAAAGATTATATGAGGCCTGTA

TATTTTCAAAATTCGATATGAAAAGTGGATTTTGGCAAATACAAATTGCCGAAAAGGATA

AATACAAGACAGCATTCACAGTGCCTTTTGGGCATTACGAATGGAACGTCATGCCTTTTG

GCTTAAAAAATGCACCTTCAGAATTCCAAAACATTATGAATGAAATTTTTAACCCTTACA

CAACTTTTTCTATCGTATATATAGATGATGTTTTAATATTTTCCAAATCTATTGACCAAC

ACTTTAAACACTTATACACCTTTTTAAACATTGTTAAAAAGCATGGACTAGTAGTATCAG

CCAAAAAAATGCAAATATTTCAAACAAAAATACGATTTTTAGGCCATAATATTTATCAAG

GAACTATAACACCAATATCTAGATCAATAGAATTTGTAAGCAAATTTCCAGATGAAATCA

AAGAGAAAACCCAATTACAAAGATTTTTAGGGTGTTTAAACTATATATCAGATTTTCTAC

CAAACCTTAGAAAAACAATTCAACCACTATTTCAAAGATTGCAAAAAAATCCCATACCAT

GGTCTAGTCTGCATACTAGTCTAGTTCGTGACATTAAGAAGAAAGTTACAACACTACCAT

GTCTAGTCATCCCACACCCTAATGCATTCATGATAGTTGAGACAGATGCATCAGAAATAG

GTTACGGGGGGATCCTTAAACAAAACTGCCAGAGTCTACCCAAGAGTCTATAGTCCGTTT

TCATTCAGGGGTTTGGCTTGGACCCCAAAAGAATTATTCTACTGTTAAAAAAGAAGTTTC

ATCTATAGTAAACTGTATTTCTAAATTTCAAGATGATTTAATAAACAAAAAGTTCTTACT

ACGTGTCGACTGTAAGTCAGCTAAAGAGATTTTACAAAAAGATGTTAAAAATTTAGTTTC

TAAACAAATATTTGCTAGATGGCAAGCTATTTTATCCGTATTCGACTTCGATATACAATA

TATAAAAGGAGAAAATAATTCATTACCTGATTTTCTAACAAGAGAGTGTTTACAGGGAAA

ATCTCAGGACTATCAAAATGAGTGAAACACAAAAGAAGCCAATGTGTGCATCAGACTATG

TCAACAATCAACCGCACCTACAAGGAAAGCAAATAACTACTGGTAACCAATTCTCTGCTT

TAGCAGAATTCCCTCCTTTATCTTATGCAAAAGCTGTCAACCCCCAACCACAAAAAATAT

CAACACCATCCTCCTCTCAAAAAACCTCAGACCAAAAACCATCATACTTCCTAAAACCAC

AACGCCAACATCTTATTACAACCTCATTTACTAAACCAATATCTCTCAAAGACCTTACCC

AATATACCAACTGTATTTTTTACGAGGATAGTCAATACCTTACCGACAACCTTACCAAAA

ACCATACATTCTACGAATTCATTCTCGTAGATACAAAGTCAGTTGAAATAACCCACCATA

CCGACAAAAATAACCCAAACCTCATCTCCTACTCCACTTGCAAAATACTCAAAATATGCA

ACCCCCAAGATCTCGGCTTTATTAACCTCCACACATCAAAAGATTTCTCTATACCAGGTT

ACCATATACCAAGATTTACCTACATAGATTACCAAAAAGCCTTTCTCCATACCTTTTACC

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