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Curso de doutorado


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Anexo VII

Linhas De Pesquisa/PROJETO

ÁREA DE CONCENTRAÇÃO

LINHA DE PESQUISA

PROJETOS

Biotecnologia aplicada a processos e ao tratamento de doenças

Biodiversidade de fungos

  • Diversidade e atividade biológica de fungos endofíticos associados a plantas presentes em ecossistemas do Estado de Minas Gerais

  • MERGE - Microbiological and ecological responses to global environmental changes in polar regions

  • Microbiologia Antártica: biodiversidade, ecologia e aplicações biotecnológicas

Biotecnologia aplicada a antígenos e adjuvantes para vacina e diagnóstico (leishmaniose, esquistosomose e outras doenças tropicais).

  • Avaliação da resposta imune celular, molecular e humoral em cães submetidos a diferentes protocolos vacinais e terapêuticos

  • Desenvolvimento de kit sorológico, utilizando antígenos recombinantes de amastigotas de Leishmania chagasi, capaz de discrimiar anticorpos produzidos durante uma infecção canina dos induzidos por uma vacinação

  • Participação de ecto-nucleotidases na infecção por parasitas do gênero Leishmania

  • Produção de anticorpos monoclonais contra E-NTPDase de Leishmania

Desenvolvimento, estudo de estabilidade e escalonamento de sistemas nanoestruturados

  • Desenvolvimento de nanoemulsões e emulsões com cristais líquidos para uso farmacêutico a partir de óleos vegetais de plantas mineiras

  • Desenvolvimeto de nanoemulsões e sistemas nanoparticulados para uso como veículo de fármacos com aplicação tópica

Sinalização celular – aspectos básicos e aplicados

  • Estudo dos efeitos do extrato de açaí na resposta antioxidante e longevidade em Caenorhabditis elegans

  • Sinalização celular em resposta a estresses em planta

  • Construção de um cassete para o silenciamento gênico da enzima estaquiose sintase em sementes de soja

  • Silenciamento de genes envolvidos na síntese de oligossacarídeos de rafinose em sementes de soja

  • Análise da resistência a estresse ácido em leveduras

Produção, caracterização e melhoramento de enzimas de interesse biotecnológico

  • Evolução dirigida de uma xilanase de Orpinomyces para aumento da estabilidade térmica de pH.

  • Produção de alfa-galactosidase para utilização na agroindústria

Seleção e melhoramento de microrganismos para a produção de bebidas, biocombustíveis, enzimas, tratamento de resíduos e produção de etanol de segunda geração

  • Sacarificação enzimática de biomassa lignocelulósica para produção de etanol de segunda geração

  • Engenharia da levedura Kluyveromyces marxianus para produção de etanol a partir de bagaço de cana

  • Estudos sobre a ocorrência de fermentação mista na produção da cachaça de alambique

  • Utilização de resíduos da produção de biodiesel para a produção de etanol por células de leveduras

Genômica e proteômica

Biologia de Sistemas de Xanthomonas citri

  • Análise do potencial funcional das vias de degradação de compostos aromáticos obtidas a paritr de análise comparativa do genoma de Xanthomonas citri subsp. citri

  • XanthomonOMICS: criação, manutenção e desenvolvimento de ferrramentas computacionais voltadas para a Biologia de Sistemas de Xanthomonas citri subsp. citri

Modelos físicos aplicados a bioinformática

  • Estabilidade térmica de DNA e RNA

  • Localização de microRNA precursores e seus alvos

Investigação proteômica aplicada à identificação e caracterização de biomarcadores em organismos eucariotos

  • Identificação proteômica de fatores Von Willebrand

  • Emprego da proteômica na identificação de biomarcadores parasitológicos para fins de diagnóstico e prognóstico

Prevenção, diagnóstico e tratamento de câncer induzido quimicamente

  • Síntese de peptídeos sintéticos análogos do inibidor Bowman-Birk para aplicação na prevenção e tratamento do câncer

Vias de sinalização reguladas por processamento de RNAs ou por modificações pós-traducional de proteínas

  • Proteólise dependente de proteassoma e independente de ubiquitina em Trypanosoma cruzi

  • Análise mecanística do efeito anti-inflamatório de inibidores comerciais das enzimas COX-1 e COX-2 em células cardíacas

  • Análise mecanística dos processos de indução de hipertrofias cardíacas mediadas por inflamação: estudo funcional da proteína CUGBP2

Anexo VIII

Professores/Orientadores

Professor(a)

Curriculum

E-mail

Alexandre Barbosa Reis

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4793625Z4

alexreis@nupeb.ufop.br

Gerald Weber

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780892D8

gweberbh@gmail.com

Ieso de Miranda Castro

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787281A9

imcastro@nupeb.ufop.br

Karen Cristiane Martinez de Moraes

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4707386T6

karenmoraes@iceb.ufop.br

Leandro Márcio Moreira

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4736486A6

lmmorei@gmail.com

Luciano Gomes Fietto

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4763824H8

lgfietto@ufv.br

Luis Carlos Crocco Afonso

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4789739U0

afonso@nupeb.ufop.br

Luiz Henrique Rosa

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4707837Z6

lhrosa@icb.ufmg.br

Milton Hercules Guerra de Andrade

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788176U9

mguerra@nupeb.ufop.br

Orlando David Henrique dos Santos

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4772740H2

orlando@ef.ufop.br

Renata Guerra de Sá Cota

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799190H2

rguerra@iceb.ufop.br

Riva de Paula Oliveira

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728428Z3

rivaoliveira@nupeb.ufop.br

Rodolfo Cordeiro Giunchetti

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4765683A2

giunchetti@nupeb.ufop.br

Rogelio Lopes Brandão

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787771E1

rlbrand@nupeb.ufop.br

Sebastião Tavares de Resende

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787599A3

srezende@ufv.br

Silvana de Queiroz Silva

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766788Z7

silvana@iceb.ufop.br

Valéria Monteze Guimarães

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4798758T3

vmonteze@ufv.br

William de Castro Borges

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4772912P4

wborges@iceb.ufop.br


ANEXO IX

RELAÇÃO DE PUBLICAÇÕES, PATENTES, CAPÍTULOS DE LIVROS DO CORPO DOCENTE NO PERÍODO 2009-2011

GERALD WEBER

  • WEBER, G. ; HASLAM, N. ; ESSEX, J. W. ; NEYLON, C. . Thermal equivalence of DNA duplexes for probe design. Journal of Physics. Condensed Matter, v. 21, p. 034106-11, 2009. B1 2,332

  • MACHADO, R. F. ; WEBER, G. . Wavelet coefficients as a guide to DNA phase transitions. Europhysics Letters, v. 87, p. 38005, 2009. B1 2,753



  • WEBER, G. ; ESSEX, J. W. ; NEYLON, C. . Probing the microscopic flexibility of DNA from melting temperatures. Nature Physics (Print), v. 5, p. 769-773, 2009. A1 18,423

  • NUNES, M. C. S. ; WANNER, E. F. ; WEBER, G. Origin of multiple periodicities in the Fourier power spectra of the Plasmodium falciparum genome. BMC Genomics, 12, (sulpl4) S4, 2011. A2 4,206

  • WEBER, G. . Finite-enthalpy model parameters from DNA melting temperatures. Europhysics Letters (Print), v. 96, p. 68001, 2011.

  • FAGUNDES-LIMA, D. ; WEBER, G. . Comment on "SCS: Signal, Context, and Structure Features for Genome-Wide Human Promoter Recognition. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics , V9: 940-941,2012. B2 1,664

IESO DE MIRANDA CASTRO

  • dos Santos Sant'Ana, Gilzeane ; da Silva Paes, Lisvane ; Vieira Paiva, Argentino F. ; Fietto, Luciano Gomes ; TOTOLA, Antônio Helvécio ; Magalhães Trópia, Maria J. ; Lemos, Denise Silveira ; Lucas, Cândida ; Fietto, Juliana L. Rangel ; BRANDAO, R. L. ; CASTRO, Ieso de Miranda . Protective effect of ions against cell death induced by acid stress in. FEMS Yeast Research, v. 9, p. 701-712, 2009. B1 2.279

  • Rigamonte, T. A. ; Silveira, Wendel B. ; Fietto, Luciano G. ; Castro, Ieso M. ; Breunig, Karin D. ; Passos, Flávia M.L. . Restricted sugar uptake by sugar-induced internalization of the yeast lactose/galactose permease Lac12. FEMS Yeast Research, v. 11, p. 243-251, 2011. B1 – 2,279

  • Ruiz JC ; D'Afonseca V ; Silva A ; Ali A ; Pinto A. C. ; Rocha, A. A. M. C. ; Lopes, D. O. ; DORELLA, F. A. ; Pacheco L. G. C. ; Costa, M. P. ; Turk, M. Z. ; Seuffert, N. ; Moraes, P.M.O. ; Soares, S.C. ; Almeida, S. S. ; Castro, T. L.P. ; Abreu, V.A.C. ; Trost, E. ; Baumbach, J. ; Tauch, A. ; McCulloch, J. ; Cerdeira, L.T. ; Ramos, R. T.J. ; Zerlotini, A. ; Dominitini, A. ; Resende, D.M. ; Coser, E. M. ; Oliveira, L.M. ; Pedrosa, A. L. ; Guimaraes, C. T. ; Vieira, C. U. ; Bartholomeu, D. C. ; Santos, F. R. ; Rabelo, E. M. ; Lobo, F. P. ; FRANCO, G. R. ; Costa, A.F. ; Castro, Ieso M. ; Dias, S.R.C. ; Ferro, J.A. ; ORTEGA, J. M. ; PAIVA, L. V. ; GOULART FILHO, Luis Ricardo ; Almeida, J.F. ; Ferro, M. I. T. ; CARNEIRO, N.P. ; Fallcao, P.R.K. ; Teixeira, S.M.R. ; BROMMONSCHENKEL, S.H. ; OLIVEIRA, Sérgio Costa ; Meyer, R. ; Moore, R. ; Miyosho, A. ; OLIVEIRA, G.C. ; AZEVEDO, Vasco . Evidences for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence in Two Corynebacterium pseudotuberculosis strains. Plos One, v. 6, p. e18551, 2011. A1 4.411

  • Souza, Anderson Proust Gonçalves ; VICENTE, Maristela de Araújo ; Klein, Raphael Contelli ; Fietto, Luciano Gomes ; COUTRIM, Maurício Xavier ; Cássia Franco Afonso, Robson José ; Araújo, Leandro Dias ; Silva, Paulo Henrique Alves ; Bouillet, Leoneide Érica Maduro ; Castro, Ieso Miranda ; BRANDAO, R. L. . Strategies to select yeast starters cultures for production of flavor compounds in cachaça fermentations. Antonie van Leeuwenhoek (Gedrukt), v. 101, p. 379-392, 2012. B2 1,673

  • Bouillet, L.E.M. ; CARDOSO, A.S. ; Perovano, E. ; Pereira, R.R. ; Ribeiro, E.M.C. ; Trópia, M.J.M. ; FIETTO, L.G. ; Tisi, R. ; MARTEGANI, E. ; Castro, I.M. ; Brandão, R.L. . The involvement of calcium carriers and of the vacuole in the glucose-induced calcium signaling and activation of the plasma membrane H+-ATPase in Saccharomyces cerevisiae cells. Cell Calcium (Edinburgh), v. 51, p. 72-81, 2012.

KAREN CRISTIANE MARTINEZ DE MORAES

  • MORAES, K. C. M. . RNA Surveillance: molecular approaches in the transcripts quality control and their implications in clinical diseases. Molecular Medicine (Cambridge), v. 16, p. 53-68, 2010. A1 5.908

  • MORAES, K. C. M. ; MACHADO, A. H. A. ; SOARES, C. P. ; Beltrame-Júnior, M ; Da Silva, N.S. . Cellular Changes After Photodynamic Therapy on HEp-2 Cells Using the New ZnPcBr Phthalocyanine. Photomedicine and Laser Surgery, v. 28, p. S-143-S-149, 2010. B2 1,633

  • Lyon, J.P. ; MORAES, K. C. M. ; Moreira L.M. ; AIMBIRE, F. ; RESENDE, M. A. . Candida albicans: genotyping methods and clade related phenotypic characteristics. Brazilian Journal of Microbiology (Impresso), v. 41, p. 841-849, 2010. B3 – 0,632

  • MACHADO, A. H. A. ; PACHECO-SOARES, C. ; Da Silva, N.S. ; MORAES, K. C. M. . Cellular and molecular studies of the initial process of the photodynamic therapy in HEp-2 cells using LED light source and two different photosensitizers. Cell Biology International, v. 33, p. 785-795, 2009. B2 1,747

LEANDRO MÁRCIO MOREIRA

  • MOREIRA, Leandro Marcio ; Almeida, Nalvo F ; Potnis, Neha ; Digiampietri, Luciano A ; Adi, Said S ; Bortolossi, Julio C ; da Silva, Ana C ; da Silva, Aline M ; de Moraes, Fabricio E ; de Oliveira, Julio C ; de Souza, Robson F ; Fancincani, Agda P ; Ferraz, Andre L ; Ferro, Maria I ; Furlan, Luiz R ; Gimenez, Daniele F ; Jones, Jeffrey B ; Kitajima, Elliot W ; Laia, Marcelo L ; Leite, Rui P ; Nishiyama, Milton Y ; Rodrigues Neto, Julio ; Nociti, Leticia A ; Norman, David J ; Ostroski, Eric H ; Pereira, Haroldo A ; Staskawicz, Brian J ; Tezza, Renata I ; Ferro, Jesus A ; Vinatzer, Boris A ; Setubal, Joao C . Novel insights into the genomic basis of citrus canker based on the genome sequences of two strains of Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii. BMC Genomics, v. 11, p. 238, 2010. A2 4.206

  • Moreira, Leandro M ; de Laia, Marcelo L ; de Souza, Robson F ; Zaini, Paulo A ; da Silva, Ana CR ; da Silva, Aline M ; Ferro, Jesus A . Development and validation of a Xanthomonas axonopodis pv. citri DNA microarray platform (XACarray) generated from the shotgun libraries previously used in the sequencing of this bacterial genome. BMC Research Notes, v. 3, p. 150, 2010.

  • Soares, Marcia R ; Facincani, Agda P ; Ferreira, Rafael M ; Moreira, Leandro M ; de Oliveira, Julio CF ; Ferro, Jesus A ; Ferro, Maria IT ; Meneghini, Rogerio ; Gozzo, Fabio C . Proteome of the phytopathogen Xanthomonas citri subsp. citri: a global expression profile. Proteome Science, v. 8, p. 55, 2010. B1 2,488

  • Laia, M. L. ; MOREIRA, Leandro Marcio ; Dezajacomo, J. ; BRIGATI, J. B. ; Ferreira, C.B. ; Ferro, M.I.T. ; SILVA, Ana Clauda Rasera da ; Ferro, Jesus A. ; Oliveira, Julio Cezar F. . New genes of Xanthomonas citri subsp. citri involved in pathogenesis and adaptation revealed by a transposon-based mutant library. BMC Microbiology (Online), v. 9, p. 1-17, 2009. B1 2,96

LUCIANO GOMES FIETTO

  • Rigamonte, Tatiana A. ; Silveira, Wendel B. ; Fietto, Luciano G. ; Castro, Ieso M. ; Breunig, Karin D. ; Passos, Flávia M.L. . Restricted sugar uptake by sugar-induced internalization of the yeast lactose/galactose permease Lac12. FEMS Yeast Research, v. 11, 243-251, 2011. B1 2.279

  • Alves, M. S. ; Reis, P. A. B. ; Dadalto, S. P. ; Faria, J. A. Q. A. ; FONTES, E. P. B. ; Fietto, L. G. . A novel transcription factor, Early Responsive to Dehydration 15, connects ER stress with an osmotic stress-induced cell death signal. The Journal of Biological Chemistry (Print), p. X, 2011. A1 5,328

  • Souza, Anderson Proust Gonçalves ; Vicente, Maristela de Araújo ; Klein, Raphael Contelli ; Fietto, Luciano Gomes ; Coutrim, Maurício Xavier ; Cássia Franco Afonso, Robson José ; Araújo, Leandro Dias ; Silva, Paulo Henrique Alves ; Bouillet, Leoneide Érica Maduro ; Castro, Ieso Miranda ; Brandão, Rogelio Lopes . Strategies to select yeast starters cultures for production of flavor compounds in cachaça fermentations. Antonie van Leeuwenhoek (Gedrukt), v. X, p. X, 2011. B2 1,673

  • Valente, M. A. S. ; Faria, J. A. Q. A. ; Soares-Ramos, J. R. L. ; Reis, P. A. B. ; Pinheiro, G. L. ; Piovesan, N. D. ; Morais, A. T. ; Menezes, C. C. ; Cano, M. A. O. ; Fietto, L. G. ; Loureiro, M. E. ; Aragao, F. J. L. ; FONTES, E. P. B. . The ER luminal binding protein (BiP) mediates an increase in drought tolerance in soybean and delays drought-induced leaf senescence in soybean and tobacco. Journal of Experimental Botany, v. 60, p. 533-546, 2009. A1 4,818

  • Brustolini, Otávio JB ; Fietto, Luciano G ; Cruz, Cosme D ; Passos, Flávia ML . Computational analysis of the interaction between transcription factors and the predicted secreted proteome of the yeast Kluyveromyces lactis. BMC Bioinformatics, v. 10, p. 194, 2009. B1 3,028

  • Pinheiro, Guilherme L. ; Marques, Carolina S. ; Costa, Maximiller D.B.L. ; Reis, Pedro A.B. ; Alves, Murilo S. ; Carvalho, Claudine M. ; Fontes, Elizabeth P.B. ; Fietto, Luciano G. . Complete inventory of soybean NAC transcription factors: Sequence conservation and expression analysis uncover their distinct roles in stress response. Gene (Amsterdam), v. 444, p. 10-23, 2009. B1 2,266

  • dos Santos Sant’ana ; da Silva Paes, Lisvane ; Vieira Paiva, Argentino F. ; Fietto, Luciano Gomes ; Totola, Antônio Helvécio ; Magalhães Trópia, Maria J. ; Lemos, Denise Silveira ; Lucas, Cândida ; Fietto, Juliana L. Rangel ; Brandão, Rogelio L. ; Castro, Ieso de Miranda . Protective effect of ions against cell death induced by acid stress in. FEMS Yeast Research, v. 9, p. 701-712, 2009. B1 2,279

Softwares com registro de patente

  • Soares Z. G. ; Soares F. G. ; Fietto, L. G. . BRa - Blast Result Analysis. Código: 10991-1/2010. 2x A2 170 pts

LUIS CARLOS CROCCO AFONSO

  • Leishmania amazonensis impairs DC function by inhibiting CD40 expression via A(2B) adenosine receptor activation. Figueiredo AB, Serafim TD, Marques-da-Silva EA, Meyer-Fernandes JR, Afonso LCC.Eur J Immunol. 2012 May;42(5):1203-15.

  • de Souza, Miriam Conceição ; de Assis, Elisângela Aparecida ; Gomes, Rodrigo Saar ; Marques da Silva, Eduardo de Almeida ; MELO, Maria Norma ; Fietto, Juliana Lopes Rangel ; Afonso, Luís Carlos Crocco . The influence of ecto-nucleotidases on Leishmania amazonensis infection and immune response in C57B/6 mice. Acta Tropica, v. 115, p. 262-269, 2010. B1 2.262

  • Côrtes, Denise Fonseca ; Carneiro, Matheus Batista Heitor ; Santos, Liliane Martins ; Souza, Talita Correia de Oliveira ; Maioli, Tatiane Uceli ; Duz, Ana Luiza C ; Ramos-Jorge, Maria Letícia ; Afonso, Luis Carlos Crocco ; Carneiro, Claudia ; Vieira, Leda Quercia . Low and high-dose intradermal infection with Leishmania major and Leishmania amazonensis in C57BL/6 mice. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso), v. 105, p. 736-745, 2010. B2 2.058

  • Grenfell, Rafaella FQ ; Marques-da-Silva, Eduardo A ; Souza-Testasicca, Miriam C ; Coelho, Eduardo AF ; FERNANDES, Ana Paula ; Afonso, Luís Carlos C ; Rezende, Simone A . Antigenic extracts of Leishmania braziliensis and Leishmania amazonensis associated with saponin partially protects BALB/c mice against Leishmania chagasi infection by suppressing IL-10 and IL-4 production. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso), v. 105, p. 818-822, 2010. B2 2.058

  • NEUMANN, E. ; Ramos, M.G. ; Santos, L.M. ; Rodrigues, A.C.P. ; Vieira, E.C. ; Afonso, L.C.C. ; Nicoli, J.R. ; Vieira, L.Q. . Lactobacillus delbrueckii UFV-H2b20 induces type 1 cytokine production by mouse cells in vitro and in vivo. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, v. 42, p. 358-367, 2009. B3 1.15



  • Guedes, Paulo M.M. ; Veloso, Vanja M. ; Afonso, Luis C.C. ; Caliari, Marcelo V. ; Carneiro, Cláudia M. ; Diniz, Lívia F. ; Marques-da-Silva, Eduardo A. ; Caldas, Ivo S. ; Do Valle Matta, Maria A. ; Souza, Sheler M. . Development of chronic cardiomyopathy in canine Chagas disease correlates with high IFN-?, TNF-α, and low IL-10 production during the acute infection phase. Veterinary Immunology and Immunopathology (Print), v. 130, p. 43-52, 2009. B1 2.176

  • Cangussú, Silvia Dantas ; Souza, Carolina Carvalho de ; Campos, Camila França ; Vieira, Leda Quercia ; Afonso, Luís Carlos Crocco ; Arantes, Rosa Maria Esteves . Histopathology of Leishmania major infection: revisiting L. major histopathology in the ear dermis infection model. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso), v. 104, p. 918-922, 2009. B2 2.058



  • Patarroyo, J.H. ; Vargas, M.I. ; González, C.Z. ; Guzmán, F. ; Martins-Filho, O.A. ; Afonso, L.C.C. ; Valente, F.L. ; Peconick, A.P. ; Marciano, A.P. ; Patarroyo V, A.M. . Immune response of bovines stimulated by synthetic vaccine SBm7462 against Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Veterinary Parasitology (Print), v. 166, p. 333-339, 2009. B1 2,331




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